Program Studi Magister Pembangunan Wilayah dan Kota Universitas Diponegoro terdapat beberapa Laboratorium dengan fungsi yang berbeda-beda.Diantara nama-nama laboratorium meliputi:
- Laboratorium Geomatika dan Komputasi Perencanaan
- Laboratorium Pengembangan Wilayah dan Manajemen Lingkungan
- Laboratorium Pengembangan Kota
- Laboratorium Perancangan Ruang Fisik dan Perkotaan